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[xml-decid] INFO : Projet "Worlwide Botanical Knowledge Base"

Subject: [xml-decid] INFO : Projet "Worlwide Botanical Knowledge Base"
From: Jean-Marc Vanel (jmvanel@free.fr)
Date: 13/03/2000 - 15:27


Paris, France, lundi 13 mars 2000

Projet "Worlwide Botanical Knowledge Base"
Appel pour une base de données botaniques mondiale.

La finalité est de créer une base de connaissance botanique comprenant
toutes les données de base :

    - description des espèces, y compris images
    - répartition géographique

Ceci sera accessible soit via Internet, soit en local via un CD/DVD. Le
but final est la protection de la biodiversité. Et là, je cite notre
"Appel pour une base de données botanique mondiale" :

"A l'heure où des milliers d'espèces disparaissent, sans espoir de
retour, parfois avant même d'être décrites, il serait irresponsable (et
absurde) de ne pas faire l'inventaire du patrimoine biologique de notre
terre. Comment conserver ce qu'on ne connaît pas? Or une connaissance
d'accès trop difficile est inutilisable. A l'heure actuelle un botaniste
doit voyager pour étudier des herbiers, des bibliothèques; par manque
d'accès à l'information il est conduit à retarder des publications
d'espèces nouvelles, ou à publier des synonymes.

Il est évident que seule l'informatique peut réaliser et rendre
accessible cet inventaire. Il n'y a pas actuellement d'autre projet
botanique ayant une envergure suffisante. "

Rendre accessible, cela veut dire en particulier offrir une assistance
en ligne sur le Web à l'identification d'un spécimen de plante,
utilisant conjointement des questions-réponses et la reconnaissance
informatique d'une image du spécimen. On vise à inclure toutes les 250
000 et quelques espèces de plantes; les mêmes techniques peuvent bien
sûr s'appliquer en zoologie et microbiologie.

Le deuxième volet est de promouvoir un standard (un vrai) de
représentation des descriptions biologiques et de la façon dont elles
sont publiées sur le Web. La solution passe par une utilisation
judicieuse des standards du World Wide Web Consortium (en essayant aussi
d'influer sur leur évolution), en particulier XML.

Ces standards du Web permettront non seulement de publier une
information de base (tirée des Flores classiques), mais aussi de (pour
les chercheurs) publier de l'information (par ex. étude de terrain) qui
fasse explicitement référence à l'information de base. Ainsi l'ensemble
des informations biologiques publiées formera un réseau sémantique, qui
sera exploitable pour toute sortes de requêtes: corrélations,
recoupements, synthèses. Ce réseau sémantique, basé sur les concepts du
Web, n'aura une fois lancé, plus guère besoin d'être supervisé; il sera
rempli par les contributions des naturalistes du monde entier.

Bien entendu, il ne s'agit pas de réinventer la roue en matières de
logiciels, mais de réutiliser les logiciels libres et les projets de
recherche existants, de motiver et maintenir des collaborations avec les
développeurs de logiciels libres, les bioinformaticiens, les chercheurs
en Intelligence Artificielle.

Encore une chose importante est qu'il ne s'agit pas essentiellement d'un
projet de recherche, même s'il y a beaucoup de recherche autour. C'est
un projet de système d'information qui, dans le cadre d'un cycle de
développement itératif, veut produire rapidement un système utile et
reconnu. Les informations et logiciels seront "free software" et "free
content".

Pour en savoir plus :
-------------------

Base de données botaniques mondiale (en français et en anglais) :
Worlwide Botanical Knowledge Base.
http://wwbota.free.fr/

Par Jean-Marc Vanel

Retrouvez cet article en ligne
(http://xmlfr.org/actualites/decid/000313-0002.xml).

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